大清康熙皇帝將台灣、澎湖納為行政版圖後,採行「班兵制度」接管當地,其中澎湖老城區(媽宮三甲)地區在同時也進駐了大量軍隊(軍隊約2000人,全澎湖群島的老百姓人口,也不過推估3000人而已),這些軍隊的士兵組成來自不同的籍貫,即如附圖:

班兵制度出於閩籍出身的李光地提議,源自班兵是「三年一換」、「三年一班」,即派駐到一個地方之後,每三年就要從原籍重新抽調一批來媽宮換防。
這套制度原意是台灣澎湖乃新收之地,又地處帝國版圖邊陲,若遇叛亂則調兵鎮壓不易,士兵從內地調派,三年一戍,可以預防士兵熟悉當地之前,施行調離,降低據地叛亂的可能性。
但這套輪替制度差不多施行150年左右,在清朝中葉的道光朝因先後經歷鴉片戰爭,西藏和新疆的動亂,連年動亂導致兵源不足,澎湖和台灣皆無法維持「三年一換」的規制,被迫滯留澎湖的班兵也陸續在當地落地生根,甚至娶妻生子的狀況也愈來愈普遍。
澎湖媽宮三甲地區滯留人口數以泉州三邑(晉江、惠安、南安)、漳州銅山(東山島)以及福州府海壇島的班兵最為多,也差不多是在1945年之前,澎湖媽宮三甲地區居民原始籍貫分布來源。